Вы не должны фиксировать / включать ваш файл .env
в ваш репозиторий git, потому что env означает среду. У вас будут разные переменные среды для ваших локальных, STAGING (разработка), производственных сред.
т.е. ваш локальный файл .env может иметь что-то вроде
WEB_HOST=localhost
WEB_PORT=8000
ALLOWED_HOSTS=127.0.0.1, localhost
но у вашего PRODUCTION .env будет что-то другое, например
WEB_HOST=www.mysite.com
WEB_PORT=8080
ALLOWED_HOSTS=www.mysite.com
Именно поэтому вы не можете включить ваш .env в репозиторий, и его следует создавать в зависимости от среды.