Я бы написал ваше приложение PHP так, чтобы оно имело доступный API RESTful, к которому может подключиться приложение C #. Таким образом, вы можете использовать такую технологию, как WCF, для связи с вашим веб-интерфейсом API и использовать C # в настольном приложении для представления и работы с данными, управляемыми в приложении PHP.
Вы рассчитываете вернуться на 15 лет назад к архитектуре клиент-сервер ... неплохо, но все уроки, которые мы выучили, пригодятся вам сейчас.