Проблема установки с августом 3.3.2

Question

mkdir -p bin cd src && make make [1]: вход в каталог /home/dcb/Documents/sof/augustus-3.3.2/src' echo "-Wall -Wno-sign-compare -Wno-strict-overflow -pedantic -g -ggdb -O3 " > cxxflags make[1]: Leaving directory / home / dcb / Documents / sof / augustus-3.3.2 / src 'cd auxprogs && make make [1]: вход в каталог /home/dcb/Documents/sof/augustus-3.3.2/auxprogs' cd bam2hints; make; make[2]: Entering directory / home / dcb / Documents / sof / augustus-3.3.2 / auxprogs / bam2hints 'g ++ -Wall -O2 -o bam2hints bam2hints.o -lbamtools -lz / usr / bin / ld: /usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.8/../../../x86_64-linux-gnu/crti .o: нераспознанное перемещение (0x2a) в разделе .init' /usr/bin/ld: final link failed: Bad value collect2: error: ld returned 1 exit status make[2]: *** [bam2hints] Error 1 make[2]: Leaving directory / home / dcb / Documents / sof / augustus-3.3.2 / auxprogs / bam2hints 'make [1]: * [все] Ошибка 2 make [1]: Выход из каталога `/home/dcb/Documents/sof/augustus-3.3.2/auxprogs 'make: * [все] Ошибка 2

Answer 1

Установка через Conda может помочь

• загрузить miniconda

wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

• установить augustus

conda install -c bioconda augustus