Если вы попытаетесь установить NetFx20SP2_x86.exe в системе x64, вы получите следующее сообщение об ошибке:
Не удается установить на 32-разрядную версию
система
Если вы уже установили среду выполнения .NET x64, вы фактически получаете версии как x64, так и x86. То, что будет использовано, зависит от того, с какой платформы собирается сборка (ключ компилятора / platform). Для AnyCPU он будет использовать x64, в противном случае он будет использовать все, что было указано.