SQL Server Compact Edition - это, ради обсуждения, MS SQL Server, сжатый в один .DLL для одного пользователя (хорошо, я знаю, что это немного сложнее, но это будет сделано ради обсуждение).
Таким образом, после записи данные должны сохраняться до тех пор, пока они не будут удалены почти таким же образом, как вы ожидаете, что они сохранятся в экземпляре сервера.
Если данные не сохраняются, я бы удивился, что происходит с файлом данных между вызовами.
Я также не уверен, можно ли им манипулировать с помощью SQL Server Management studio, хотя это файл .MDF.