Если вы хотите JPA 2.1, я настоятельно рекомендую перейти на WebSphere Liberty (предпочтительно), поскольку он полностью поддерживает это, и у вас уже есть лицензия на это, если у вас есть WAS 8.5, или переходите на tWAS 9.0. На WAS 8.5.x вам нужно будет отключить сканирование JPA, использовать постоянство, управляемое приложением, создать общую библиотеку ... не очень стоит.
В дополнение к изменениям настроек сервера вам придется перенести ваше приложение из OpenJPA в EclipseLink. Существует бесплатный плагин Eclipse - WebSphere_Application_Server_Migration_Toolkit , который вы можете настроить для сканирования источников вашего приложения на предмет миграции OpenJPA -> EclipseLink.
Но и для WAS 8.5.x -> миграция WebSphere Liberty; -)