Я мог бы ответить на свой вопрос здесь, но не стесняйтесь прыгать со своими мыслями.
Ответ Хавьера (+1) привел меня к мысли, что, возможно, смысл в том, что наличие более одного уникального индекса может быть плохой вещью, если элементы в этом индексе совершенно не связаны.
Другими словами, вы увеличиваете вероятность того, что реальные данные невозможно сохранить из-за ограничений уникальности вторичных индексов. Это также потенциально может создать искусственные ограничения для данных, которые не обязательно должны быть там.