Я думал, что вспомнил, что современная флеш-память хороша для сотен тысяч переписываний. Насколько мне известно, количество операций чтения не ограничено.
Если вам от этого легче, Windows Vista поддерживает функцию ReadyBoost, которая позволяет распределять пространство кеша на USB-накопителе для повышения производительности. Я думаю, если вам удастся как-то выровнять записи, у вас все будет в порядке.
Кроме того, некоторые модули флэш-памяти имеют встроенные контроллеры со встроенной оптимизацией записи, поэтому они будут пытаться выполнять запись в различные области памяти при последующих операциях записи. Вы, вероятно, не можете рассчитывать на это, хотя, если вы точно не выясните, есть ли на вашей конкретной карте памяти встроенный контроллер (в частности, SD не имеет встроенного контроллера, но, возможно, у него все еще есть какой-то другой механизм, с помощью которого это выравнивает записи).
РЕДАКТИРОВАТЬ: вот ссылка, которая объясняет износ памяти и «выравнивание износа» более подробно:
http://en.wikipedia.org/wiki/Flash_memory#Memory_wear