Возможно, это не то решение, которое вы ищете, но попробуйте использовать pipenv.
sudo pip install pipenv
cd /path/to dir # go to project directory
pipenv --python 3.7.3 # python version you wish to use
pipenv install cython
pipenv install numpy # numpy seems to be a dependancy of pot
pipenv install pot
работает как шарм!