Ниже приведено минимальное решение:
$line2 =~ s/\$(\w+)/$ENV{$1}/g;
Конечно, вы, возможно, захотите обрабатывать переменные, которые не определены более четко, и вам может потребоваться какой-то механизм экранирования, предотвращающий специальное значение $
.