Нужно попытаться найти способ запустить .exe от имени другого пользователя, однако учетные данные пользователя должны быть жестко запрограммированы в сценарии, а не введены вручную.
Я пытался возиться с подпроцессомно, похоже, это не работает, так как скрипты ломаются.