После того, как я прочитал все возможные похожие темы, я понял это.
В текущей версии eclipselink (2.7.4), если вы добавите jakarta.persistence_2.2.2.jar вместе с eclipselink.jar, эта проблема возникает. Оба jar-файла имеют несколько классов и пакетов с одинаковыми именами. Чтобы это исправить, вы должны добавить jakarta.persistence_2.2.2.jar перед eclipselink.jar. Так что все занятия взяты из Джакарты не частично.
Я не совсем понимаю, как эти две библиотеки взаимодействуют друг с другом, но поменял порядок в пути сборки.