Как объединить несколько групповых агрегаций с вычисляемым столбцом?

Question

Отказ от ответственности: я - врач без формального обучения, которому поручено составить отчет, в котором рассматривается, сколько пациентов достигает целей терапии, и мне нужно разбить его по учреждениям и клиникам.Я могу получить знаменатель (общее количество случаев в зависимости от учреждения и клиники) и числитель (общее количество случаев, соответствующих целям терапии), но я не могу понять, как отобразить оба из них в группе вместе со столбцом, показывающим процент целей встречи (num / denom).

Пример кадра данных:

import pandas as pd

df = pd.DataFrame([[1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15],
                   ['anxiety','PTSD','PTSD','anxiety','PTSD','depression','anxiety','anxiety','PTSD','anxiety','anxiety','anxiety','depression','depression','PTSD'],
                   [False,False,False,True,True,False,True,False,False,False,False,False,False,False,False],
                   ['120C','120C','120C','120C','120C','120C','120C','120C','120C','120C','375C','375C','375C','375C','375C'],
                   ['BH-PSYL','BH-PSYL','BH-YUKON','BH-DENALI','BH-YUKON','BH-DENALI','BH-CFS','BH-CFS','BH-CFS','BH-CFS','BH-HTHPSY','BH-HTHPSY','BH-BSS','BH-HTHPSY','BH-BSS']]).T
df.columns = ['Patient ID','DX Category','Met Goal','Facility','Clinic']

Это дает знаменатель:

df.groupby(['Facility', 'Clinic']).count()[['Met Goal']]

Это дает числитель:

df[df['Met Goal'] == True].groupby(['Facility', 'Clinic']).count()[['Met Goal']]

Окончательный результат должен показывать (вымышленные номера):

Facility | Clinic   | Met Goal | Cases | Percent
120C
         | BH-PSYL  |     1    |   4   |  25%
         | BH-YUKON |     2    |   6   |  33%
375C     
         | BH-CFS   |     0    |   1   |   0%

Любая помощь приветствуется!

Answer 1

Вы сделали большую часть работы, но чтобы получить окончательный результат, вы можете сделать:

#first calculate at once the numerator and denominator in the same dataframe
df_final = df.groupby(['Facility', 'Clinic']).agg({'Met Goal':['sum', 'count']})
#then change the name of the columns
df_final.columns = ['Met Goal','Cases']
#finally calaulate the percent
df_final['Percent'] = df_final['Met Goal']/df_final['Cases']

и вы получите:

print (df_final)
                    Met Goal  Cases  Percent
Facility Clinic                             
120C     BH-CFS            1      4     0.25
         BH-DENALI         1      2     0.50
         BH-PSYL           0      2     0.00
         BH-YUKON          1      2     0.50
375C     BH-BSS            0      2     0.00
         BH-HTHPSY         0      3     0.00