Проверьте, какой Git использует ваш TortoiseGit:
Если это системная версия (Git, который вы установили независимо от Git), в последней версии Git для Windows 2.22 (при условии, что здесь Windows) действительно есть новое всплывающее окно с просьбой выбрать менеджера. Это может быть проблемой.
Повторите попытку запуска TortoiseGit после первого ввода:
git config --global credential.helper manager