регулярное выражение - объединение нескольких условий в grep

Question

Мне трудно объединить два условия в grep.

Мое первое условие - 'GT' находится в середине строки.

Строки состоят из 12 символов,поэтому GT охватывает позиции от 5 до 6.

Мое второе условие - «C» не появляется до появления «GT» в средней позиции.

Пока у меня есть

grep -E '^.{5}GT' *.txt | grep -E '^[^C]*GT'

, но при этом выводятся недопустимые строки, такие как

GT C TG GT GAGTT

Я полагаю, что код интерпретирует первое вхождение GT как второе условие и позволяет выводить его.

Как я могу сделать улучшения?

Answer 1

Итак, вы хотите:

• ровно 5 символов, ни один из которых не является C: [^C]{5}
• GT
• любые 5 символов: .{5}

Соединение (привязка между ^...$):

grep -E '^[^C]{5}GT.{5}$' *.txt

Answer 2

Использование класса отрицательных символов [^C]* будет соответствовать любому символу, например, также 5 пробелов и, например, также будет соответствовать GT

Если возможные значения GTAC, вы можете повторить либо G, T или A 5 раз, затем сопоставить GT с последующим сопоставлением GTAC 5 раз до конца строки:

^[GTA]{5}GT[GTCA]{5}$

Regex demo

например:

grep -E '^[GTA]{5}GT[GTCA]{5}$' *.txt