Срок офсетного взаимодействия - PullRequest
0 голосов
/ 09 апреля 2019

Я хочу вписать модель coxph в r и сместить один основной эффект и термин взаимодействия.

Я пытаюсь использовать команду смещения перед переменной, но она выдает ошибку: Ошибка в model.frame.default (формула = Surv (время = X, событие = дельта) ~: переменные длины отличаются (найдено для 'offset (D: Y)')

Мы можем сгенерировать некоторые игрушечные данные, такие как

require(survival)
D = rbinom(100, 1, 0.5)
Y = rbinom(100, 1, 0.5)
X = rexp(100, 1)
Delta = rbinom(100, 1, 0.5)
coxph(Surv(time = X, event = Delta) ~ D + offset(Y) + offset(D:Y))

Я хочу сместить Y и D: Y, но это продолжает давать мне ошибку. Возможно, я ошибаюсь, как использовать «смещение».

1 Ответ

0 голосов
/ 24 июня 2019

Несмотря на то, что вы используете выражение D:Y в выражении формулы, оно сначала обрабатывается offset, который на самом деле не «знает», что делать с оператором «:» в формуле R:разбор контекста.Вместо этого он выдает предупреждающее сообщение о том, что он анализируется как оператор целочисленной последовательности.

Error in model.frame.default(formula = Surv(time = X, event = Delta) ~  : 
  variable lengths differ (found for 'offset(D:Y)')
In addition: Warning messages:
1: In D:Y : numerical expression has 100 elements: only the first used

Если вы хотите использовать произведение D и Y в качестве дополнительного смещения "взаимодействия", то вы могли бы сделать это:

> coxph(Surv(time = X, event = Delta) ~ D + offset(Y) + offset(I(D*Y)))
Call:
coxph(formula = Surv(time = X, event = Delta) ~ D + offset(Y) + 
    offset(I(D * Y)))

     coef exp(coef) se(coef)      z        p
D -0.9959    0.3694   0.2825 -3.525 0.000423

Likelihood ratio test=12.26  on 1 df, p=0.0004635
n= 100, number of events= 53 

И, глядя на это, я подумалвозможно, даже сбросив I (), так как смещение не использовало логику синтаксического анализа формулы в любом случае.И это оказалось так.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...