Вы пытались поместить цитаты вокруг ul # портфолио li? Селектор - это просто строка, поэтому он нуждается в кавычках. Без кавычек не работает даже в моем Firefox.
$("ul#portfolio li").fadeTo("slow", 0.3);
Редактировать: ОК, попробуйте применить затухание ко всем подэлементам: span и img по одному для начала. Это действительно может быть ошибка IE.
Изменить: вам также не хватает заключительной цитаты на id = "портфолио". Давай, парень, попробуй разобраться с этими вещами, прежде чем отправлять.
Edit: btw, вышеперечисленное прекрасно работает в IE8 - я просто собрал его и бросил на пустую страницу IE8 - все исчезло
Редактировать: Вполне возможно, что что-то еще на вашей странице делает это, так как оно работает автономно.