Когда вы открываете окно со страницей из другого домена, вы не получаете ссылку на окно обратно. Переменная ref равна нулю.
Если вы хотите переместить окно, вы должны открыть его без страницы, переместить его, а затем загрузить в него страницу:
var r = window.open ('', 'mywindow', 'location=1,status=1,scrollbars=1,width=100,height=100');
r.moveTo(0,0);
r.location.href = 'http://www.google.com';