Вам не нужно отменять регистрацию ваших обработчиков событий; они не будут вызваны при программном запуске события ...
document.forms[0].onsubmit = function() {
alert("You will not see this");
return false;
}
document.forms[0].submit();
Однако, если у вас есть объект jQuery, обязательно вызовите функцию submit базового элемента DOM ...
$("form")[0].submit();