Удаление последних слоев FC предназначено для тонкой настройки или передачи обучения, когда вы адаптируете существующую сеть к новой проблеме, такой как изменение количества категорий, которые может выбрать ваш классификатор.
Вы настраиваете сеть на вход другого размера, поэтому вам необходимо настроить первый (ые) слой (и) сети.