Как комментировать по GOplot - PullRequest
0 голосов
/ 31 мая 2019

Я собираюсь сделать обходной график на моих данных экспрессии генов, аннотированных инструментом DAVID программным обеспечением под названием GOplot, но я получаю эту ошибку

 GOChord(chord[1:10,], space = 0.02, gene.order = 'logFC', gene.space = 0.25, gene.size = 5)

Ошибка в $<-.data.frame (*tmp*, "x.start", значение = c (0, 0.145745341514158,: замена имеет 48 строк, данные имеют 42

head(chord[1:5,])
          focal adhesion cell-cell adherens junction cadherin binding involved in cell-cell adhesion muscle contraction
    MYL9               0                           0                                               0                  1
    ACTB               1                           0                                               0                  0
    ACTA2              0                           0                                               0                  1
    ACTG2              0                           0                                               0                  1
    PFN1               1                           1                                               1                  0
          fibronectin binding myelin sheath extracellular matrix \ttype I interferon signaling pathway integrin binding
    MYL9                    0             0                    0                                    0                0
    ACTB                    0             1                    0                                    0                0
    ACTA2                   0             0                    0                                    0                0
    ACTG2                   0             0                    0                                    0                0
    PFN1                    0             0                    0                                    0                0
          cytoskeleton     logFC
    MYL9             0 -1.579165
    ACTB             1 -1.482387
    ACTA2            0 -2.379757
    ACTG2            0 -2.144757
    PFN1             1 -1.158010

Любая идея, пожалуйста?

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...