r <- raster(nrow=10, ncol=10, vals=0)
Вы можете сделать это вместо обновления
r[2:(nrow(r)-1), ncol(r)] <- 10
Или сначала вычислить номера ячеек
cells <- cellFromRowCol(r, 2:(nrow(r)-1), ncol(r))
r[cells] <- 25
Или использовать номера ячеек с update
rr <- writeRaster(r, 'test.tif', overwrite=TRUE, datatype='INT2S')
# rr <- update(rr, rep(255, ncol(r)-2), cells)
rr <- update(rr, 255, cells)
Посмотрите
as.matrix(rr)
# [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6] [,7] [,8] [,9] [,10]
# [1,] 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
# [2,] 0 0 0 0 0 0 0 0 0 255
# [3,] 0 0 0 0 0 0 0 0 0 255
# [4,] 0 0 0 0 0 0 0 0 0 255
# [5,] 0 0 0 0 0 0 0 0 0 255
# [6,] 0 0 0 0 0 0 0 0 0 255
# [7,] 0 0 0 0 0 0 0 0 0 255
# [8,] 0 0 0 0 0 0 0 0 0 255
# [9,] 0 0 0 0 0 0 0 0 0 255
#[10,] 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0