Загрузка пакета, вызывающая ошибку при развертывании приложения Shiny - PullRequest
Новая
       11

Загрузка пакета, вызывающая ошибку при развертывании приложения Shiny

0 голосов
/ 27 июня 2019

Я получаю сообщение об ошибке при попытке развернуть приложение Shiny. Ранее я мог успешно развернуть это приложение. Я считаю, что это связано с пакетами, которые я загружаю, но мне трудно найти и устранить неполадки. Я думаю, что это связано с парой пакетов, и я думаю, что я определил, что цветовое пространство является причиной проблемы. Когда я удаляю цветовое пространство, я получаю ту же ошибку, поэтому думаю, что это может быть несколько пакетов.

Вот код, который я использую: 

#
# This is a Shiny web application. You can run the application by clicking
# the 'Run App' button above.
#
# Find out more about building applications with Shiny here:
#
#    http://shiny.rstudio.com/
#

library(readxl) #good
library(ggplot2) #good
library(dplyr) #good
library(stringr) #good
library(tidyr) #good
library(magrittr) #good
library(lubridate) #good
library(openxlsx) #good
library(scales) # good
library(colorspace) # bad
library(shiny) # good
library(curl) # good
library(openxlsx) # good
library(ggthemes) # unsure
library(leaflet) # unsure
library(shinythemes) # unsure
library(showtext) # unsure

# Define UI for application that draws a histogram
ui <- fluidPage(

    # Application title
    titlePanel("Old Faithful Geyser Data"),

    # Sidebar with a slider input for number of bins 
    sidebarLayout(
        sidebarPanel(
            sliderInput("bins",
                        "Number of bins:",
                        min = 1,
                        max = 50,
                        value = 30)
        ),

        # Show a plot of the generated distribution
        mainPanel(
           plotOutput("distPlot")
        )
    )
)

# Define server logic required to draw a histogram
server <- function(input, output) {

    output$distPlot <- renderPlot({
        # generate bins based on input$bins from ui.R
        x    <- faithful[, 2]
        bins <- seq(min(x), max(x), length.out = input$bins + 1)

        # draw the histogram with the specified number of bins
        hist(x, breaks = bins, col = 'darkgray', border = 'white')
    })
}

# Run the application 
shinyApp(ui = ui, server = server)

deployApp.R 

library(rsconnect)
deployApp(appName = "test2")

А вот и длинная ошибка:

deployApp (appName = "test2") Подготовка к развертыванию приложения ... СДЕЛАНО Загрузка пакета для приложения: 1002337 ... СДЕЛАНО Развертывание комплекта: 2183704 для приложения: 1002337 ... Ожидание задачи: 625897405 здание: разбор манифеста здание: Здание изображение: 2303409 building: установка системных зависимостей здание: загрузка пакетов Building: Установка пакетов Building: Установка файлов здание: Pushing image: 2303409

########################## Начало журнала задач ##################### ###########

[2019-06-27T19: 32: 38.644208763 + 0000] Выполнить сценарий: packages / build / sys.sh + set -e + apt-get update -qq + apt-get install -y libapparmor-dev Чтение списков пакетов ... Построение дерева зависимостей ... Чтение информации о состоянии ... Будут установлены следующие дополнительные пакеты: libapparmor1 Будут установлены следующие НОВЫЕ пакеты: libapparmor-DEV Следующие пакеты будут обновлены: libapparmor1 1 обновлен, 1 недавно установлен, 0 для удаления и 99 не обновлен. Нужно достать 97,3 кБ архивов. После этой операции будет использовано 230 КБ дополнительного дискового пространства. Получить: 1 http://us -east-1.ec2.archive.ubuntu.com / ubuntu xenial-updates / main amd64 libapparmor1 amd64 2.10.95-0ubuntu2.11 [29,5 кБ] Получить: 2 http://us -east-1.ec2.archive.ubuntu.com / ubuntu xenial-updates / main amd64 libapparmor-dev amd64 2.10.95-0ubuntu2.11 [67,8 кБ] debconf: задержка конфигурации пакета, так как apt-utils не установлен Получено 97,3 кБ в 0 с (7814 кБ / с) (Чтение базы данных ... (Чтение базы данных ... 5% (Чтение базы данных ... 10% (Чтение базы данных ... 15% (Чтение базы данных ... 20% (Чтение базы данных ... 25% (Чтение базы данных ... 30% (Чтение базы данных ... 35% (Чтение базы данных ... 40% (Чтение базы данных ... 45% (Чтение базы данных ... 50% (Чтение базы данных ... 55% (Чтение базы данных ... 60% (Чтение базы данных ... 65% (Чтение базы данных ... 70% (Чтение базы данных ... 75% (Чтение базы данных ... 80% (Чтение базы данных ... 85% (Чтение базы данных ... 90% (Чтение базы данных ... 95% (Чтение базы данных ... 100% (Чтение базы данных ... 119344 файлов и каталогов, установленных в настоящее время.) Подготовка к распаковке ... / libapparmor1_2.10.95-0ubuntu2.11_amd64.deb ... Распаковка libapparmor1: amd64 (2.10.95-0ubuntu2.11) поверх (2.10.95-0ubuntu2.10) ... Обработка триггеров для libc-bin (2.23-0ubuntu10) ... Настройка libapparmor1: amd64 (2.10.95-0ubuntu2.11) ... Обработка триггеров для libc-bin (2.23-0ubuntu10) ... Выбор ранее невыбранного пакета libapparmor-dev: amd64. (Чтение базы данных ... (Чтение базы данных ... 5% (Чтение базы данных ... 10% (Чтение базы данных ... 15% (Чтение базы данных ... 20% (Чтение базы данных ... 25% (Чтение базы данных ... 30% (Чтение базы данных ... 35% (Чтение базы данных ... 40% (Чтение базы данных ... 45% (Чтение базы данных ... 50% (Чтение базы данных ... 55% (Чтение базы данных ... 60% (Чтение базы данных ... 65% (Чтение базы данных ... 70% (Чтение базы данных ... 75% (Чтение базы данных ... 80% (Чтение базы данных ... 85% (Чтение базы данных ... 90% (Чтение базы данных ... 95% (Чтение базы данных ... 100% (Чтение базы данных ... 119344 файлов и каталогов, установленных в настоящее время.) Подготовка к распаковке ... / libapparmor-dev_2.10.95-0ubuntu2.11_amd64.deb ... Распаковка libapparmor-dev: amd64 (2.10.95-0ubuntu2.11) ... Обработка триггеров для man-db (2.7.5-1) ... Настройка libapparmor-dev: amd64 (2.10.95-0ubuntu2.11) ...[2019-06-27T19: 32: 46.867741305 + 0000] Установка пакета R: withr (2.1.2) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib / R / library * установка двоичный пакет с ... ... СОВЕРШЕНО (withr) [2019-06-27T19: 32: 47.177306610 + 0000] Установка пакета R: viridisLite (0.3.0) * установка в библиотеку/opt/R/3.6.0/lib/R/libraryâ €, остается * установка двоичный пакет… viridisLite… ... DONE (viridisLite) [2019-06-27T19: 32: 47.420665470+0000] Установка пакета R: crayon (1.3.4) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib / R / library * установка бинарный пакет "карандаш"€ ™ * DONE (crayon) [2019-06-27T19: 32: 47.701859695 + 0000] Установка пакета R: zeallot (0.1.0) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib/ R / library * установка бинарного пакета «zeallot» ... * DONE (zeallot) [2019-06-27T19: 32: 47.936696726 + 0000] Установка пакета R: xtable (1.8-4) * установка в библиотеку/ opt / R / 3.6.0 / lib / R / library * установка двоичного пакета ... xtable ... ... DONE (xtable) [2019-06-27T19:32: 48.197319585 + 0000] Установка пакета R: magrittr (1.5) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib / R / library * установка бинарный пакет *magrittrâ ... * DONE (magrittr) [2019-06-27T19: 32: 48.432917932 + 0000] Установка пакета R: маркировка (0.3) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib /R / library * установка бинарного пакета, маркировка ... * DONE (маркировка) [2019-06-27T19: 32: 48.644273152 + 0000] Установка пакета R: rlang (0,4.0) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib / R / library * установка бинарного пакета ... rlang ... ... DONE (rlang) [2019-06-27T19: 32: 48.944480920 + 0000] Установка пакета R: stringi (1.4.3) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib / R / library * установка двоичный пакет Stringi... * DONE (stringi) [2019-06-27T19: 32: 49.394737083 + 0000] Установка пакета R: повторное сравнение (1.0.1) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib / R/ library * установка двоичного пакета ... rematch ... ... DONE (rematch) [2019-06-27T19: 32: 49.608705910 + 0000] Установка пакета R: purrr (0.3.2) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib / R / библиотека * установка бинарный пакет ... purrr ... ... DONE (purrr) [2019-06-27T19: 32: 49.884405044 + 0000] Установка пакета R: plogr (0.2.0) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib / R / library * установка двоичный файл пакет plogr ... * DONE (plogr) [2019-06-27T19: 32: 50.151117758 + 0000] Установка пакета R: mime (0.7) * установка в библиотеку / opt / R/3.6.0/lib/R/libraryâ € "остаются" * установка двоичный пакет "MIME" ... * DONE (MIME) [2019-06-27T19: 32: 50.380404050 + 0000] УстановкаПакет R: sys (3.2) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib / R / library * установка бинарный пакет ... sys ... ... DONE (sys) [2019-06-27T19: 32: 50.623448406+0000] Установка пакета R: fansi (0.4.0) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib / R / library * установка бинарный пакет "фанат"™ ... * DONE (fansi) [2019-06-27T19: 32: 50.880863199 + 0000] Установка пакета R: packrat (0.5.0) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib /R / library * установка двоичного пакета ... packrat ... ... DONE (packrat) [2019-06-27T19: 32: 51.153169848 + 0000] Установка пакета R: utf8 (1.1.4) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib / R / library * установка бинарного пакета ... utf8 ... ... DONE (utf8) [2019-06-27T19: 32: 51.417330005 + 0000] Установка пакета R: sourcetools (0.1.7) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib / R / library * установка двоичный пакет «sourcetools» ... * DONE (sourcet)ools) [2019-06-27T19: 32: 51.706764719 + 0000] Установка пакета R: gtable (0.3.0) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib / R / library * установка бинарный пакет «gtable» ... * DONE (gtable) [2019-06-27T19: 32: 52.003780539 + 0000] Установка пакета R: R6 (2.4.0) * установка в библиотеку€ ~ / опт / R / 3.6.0 / Библиотека / R / libraryâ € ™ * установка бинарного пакета R6 ... * СДЕЛАНО (R6) [2019-06-27T19: 32: 52.226633826 + 0000] Установка пакета R: RColorBrewer (1.1-2) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib / R / library * установка бинарного пакета «RColorBrewer» ... * СДЕЛАНО (RColorBrewer) [2019-06-27T19: 32: 52.446557961 + 0000] Установка пакета R: решетка (0,20-38) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib / R / library * установка бинарного пакета «решетка» ... * СДЕЛАНО (решетка) [2019-06-27T19: 32: 52.764007778 + 0000] Установка пакета R: nlme (3.1-139) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib / R / library * установка бинарного пакета ... nlme ... * СДЕЛАНО (nlme) [2019-06-27T19: 32: 53.283749888 + 0000] Установка пакета R: MASS (7.3-51.1) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib / R / library * установка бинарного пакета "МАССА" ... * СДЕЛАНО (МАССА) [2019-06-27T19: 32: 53.616860274 + 0000] Установка пакета R: yaml (2.2.0) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib / R / library * установка бинарного пакета «yaml» ... * СДЕЛАНО (yaml) [2019-06-27T19: 32: 53.922424843 + 0000] Установка пакета R: обратные порты (1.1.4) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib / R / library * установка бинарного пакета "backports" ... * СДЕЛАНО (backports) [2019-06-27T19: 32: 54.307518695 + 0000] Установка пакета R: pkgconfig (2.0.2) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib / R / library * установка бинарного пакета pkgconfig ... * СДЕЛАНО (pkgconfig) [2019-06-27T19: 32: 54.563268370 + 0000] Установка пакета R: hms (0.4.2) * установка в библиотеку / opt / R / 3.6.0 / lib / R / library * insta ################################# Конец журнала задач ############ ##################### Ошибка: необработанное исключение: дочерняя задача 625897406 Ошибка: необработанное исключение: HTTP 599: время ожидания во время запроса

1 Ответ

0 голосов
/ 28 июня 2019

Я нашел исправление. Я использую SASS и начальную загрузку для модификации своих приложений CSS. Чтобы развернуть приложение, вам нужно переместить все файлы r и ваш окончательный файл .css в новую папку.

В противном случае при развертывании приложения произойдет сбой в разделе «Установка файлов». Я полагаю, что установка не может распознать файлы .json, .sass и т. Д.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.

Нет похожих вопросов

...