Protect (): переполнение стека защиты - PullRequest
0 голосов
/ 12 июля 2019

Я построил модель glmnet из фрейма данных 880R 24000C.Когда я запускаю его, он выдает ошибку protect (): переполнения стека защиты.

Я заставил создание модели работать с использованием пакета glmnetUtils, упомянутого в Как решить проблему «переполнения стека защиты» вR Studio , но я не могу создать прогнозы для нового фрейма данных без сообщения об ошибке.

healthy_vs_rvi = glmnet(result~., data = train_rvi, family = "binomial", alpha = 1, lambda = lam)

test_prediction <- predict(healthy_vs_rvi, newx = model.matrix(result~., test_rvi))

Итак, первая строка была исправлена ​​пакетом glmnetUtils, но я не могу получитьвторая строка для запуска без выдачи ошибки.

Я не могу поделиться данными, к сожалению, поскольку они являются конфиденциальными.Я также попытался установить ppsize на 50 000 и параметры (выражения = 5e5), но ни один не работал.Есть ли способ обойти эту проблему?

...