Запустив эти команды, вы могли случайно удалить модуль миграции.Попробуйте переустановить Django через pip.pip uninstall django
pip install django
Обратите внимание на версию Django, которую вы используете.Если вы не используете последнюю версию для своей среды Python, установите с помощью следующей команды pip install django==<version goes here>
Edit: -
Удалите существующую схему базы данных.Удалите папку миграций и создайте на ее месте пустую.