Согласно вашим описаниям, я предполагаю, что вы хотите использовать API 'https://graph.microsoft.com/v1.0/sites/{site-id}/lists'.
На основании моего теста, когда мы перечисляем все сайты по ТОП-запросу, «NextURL» не будетсуществует в ответе, если существует менее 400 веб-сайтов.
Имеется ли на вашем сайте SharePoint более 400 сайтов SharePoint?Если нет, то сколько у вас сайтов?