Я нашел, как это сделать, посмотрев источник теста и другой пост здесь:
Источник теста
Подсказка из другого поста stackoverflow
let query = GTLRYouTubeQuery_SearchList.query(withPart: "id,snippet")
var bundleIdentifier = Bundle.main.bundleIdentifier
bundleIdentifier = bundleIdentifier?.trimmingCharacters(in: .whitespacesAndNewlines)
query.additionalHTTPHeaders = ["X-Ios-Bundle-Identifier" : bundleIdentifier!]