Согласно скриншоту (getRepository, flush, persist ...) - это методы $ this-> getDoctrine () -> getManager () , которые вы можете найти на любой контроллер symfony класс:
То, что вы хотите использовать, это $ this-> getEntityManager () -> createQuery () , которое вы можете найти в symfony хранилище класс:
Таким образом, правильный способ сделать это - создать репозиторий и добавить в него свой метод, а затем использовать этот метод внутри контроллера:
class UserController extends Controller
{
/**
* @Route("/", name="user_list")
*/
public function indexAction()
{
$em = $this->getDoctrine()->getManager();
$userrs = $em->getRepository("AppBundle:User")->myRepositoryMethod();
...