Группа процессов является единицей контроля версий, поэтому изменения любых процессоров в группе процессов приведут к изменению, которое необходимо зафиксировать, не имеет значения, подключены ли процессоры или являются частью независимых логических потоков.
Если вам нужно, чтобы управление версиями было более детальным, то f1 и f2 должны быть в своих собственных вложенных группах процессов. Вы можете дать контроль версий на PG1, PG2 (f1) и PG3 (f2). Затем вы можете развернуть все это как PG1, но позже делать обновления только для подгрупп.