Не знаю, есть ли что-то особенное в ваших конкретных данных, но я не вижу этого при запуске Microsoft R Server версии 9.3.0.
> T_df <- data.frame(a = runif(101994), b = runif(101994), c = runif(101994))
> object.size(T_df)
2448752 bytes
> str(T_df)
'data.frame': 101994 obs. of 3 variables:
$ a: num 0.248 0.504 0.197 0.634 0.407 ...
$ b: num 0.226 0.686 0.556 0.629 0.412 ...
$ c: num 0.959 0.122 0.214 0.666 0.23 ...
>
> write.csv(T_df,"TFile.csv")
TFile.csv составляет 6,1 М