Git не предлагает способа сделать это изначально.Версия подмодуля для конкретной ревизии является фиксированной, и нет возможности заменить файлы в подмодуле так, как вам нужно, без поддержки вашего собственного форка.
Однако вы можете легко это сделатьизменив, как работает ваша сборка.В рамках процесса сборки вы можете скопировать все исходные файлы из одного каталога в другой и заменить или исправить файлы в этой точке, а затем выполнить сборку, используя второй каталог в качестве исходных файлов.