Это мой код:
% curl -F smiles='O=C(C(=O)O)C' -F cutoff=0.6 -F limit=10 http://rest.genome.jp/simcomp/
, но он выполняет один СМЕЙЛ за раз.У меня есть 150K SMILES в электронной таблице файлов .xlsx.
Как мне выполнить весь мой код SMILES (это тип кода SMILE: O=C(C(=O))C ), присутствующий в моем файле .xlsx сразу? Для этого я представляюэтот curl должен читать каждую строку моего файла .xlsx, конвертировать в текстовый формат и включать в определенное поле кода, не так ли?
Для каждого ответа я получаю таблицу, как показано ниже, и я хочусохраните каждый из них в .txt файлах.
C00186 0.851852
C00256 0.851852
C01432 0.851852
C00109 0.803279
C00957 0.803279
C00168 0.803279
C00972 0.803279
C17265 0.803279
C00163 0.730769
C00048 0.730769
C21297 0.718750
Следует примеру моей электронной таблицы .xlsx. Каждая строка представляет код SMILES
CCCCCc1cc(cc(c1)O)O
CCC(C)C1C(=NC(Cc2ccc(cc2)OCC=C(C)C)C(=O)N(C)C(C)C(=O)OC(Cc2ccccc2)C(=O)N2CCCC2C(=NC(C)C(=O)N1C)O)O
CCC(C)(C(=O)OCC1=CCN2CCC(C12)O)OC(=O)C
C/C/1=C\C(C)CC2(C)CCC(C34CCC(CC(C5C(=O)CC(C)(C(C6CCC7(CCCC(C(C)C(=O)OC8CC(C9(C(C(C)CCO9)O)O)OC8\C=C1)O7)O6)O)O5)O3)(CO)O4)O2
CC1CC2C3C(C)(CCCC3(C)C31CCC1(CC(O)OC1)O3)C(=O)O2
Cc1cc2C(c3cc(cc(c3C(=O)c2c(c1C(=O)C)O)OC1C(C(C(C(CO)O1)O)O)O)O)C1c2cc(C)c(C(=O)C)c(c2C(=O)c2c1cc(cc2OC1C(C(C(C(CO)O1)O)O)O)O)O
C=CC(C)(CCC1C2(C)CCCC(C)(C)C2CCC1(C)O)O
C(C1C(C(C(OCC2C(C(C(OCC3C(C(C(O)O3)O)O)O2)O)O)O1)O)O)O
CN1C2CCC(C1CC2O)O
C1C(C(CO)OC1n1cnc2c(N)ncnc12)O