Я предполагаю, что Qt Creator и интеграция с Qt Eclipse имеют разные версии конструктора, которые они используют. (Я знаю, что это относится к Creator.) Поскольку они используют разные дизайнерские приложения, они, вероятно, также ищут плагины в другом месте, чем стандартная программа Designer. Моим первым предложением было бы попытаться найти, где это место, и скопировать туда свой плагин.
Если скопированный плагин не работает, возможно, у вас есть несовместимые версии конструктора для одной или другой версии. Это займет немного больше исследований, но, вероятно, может быть преодолено немного больше исследований.