По умолчанию система не включает инструменты dev (и, следовательно, папку / Developer). Ему нужно переустановить dev-tools со своего CD (или с developer.apple.com), а также переустановить iPhone SDK (доступно только на developer.apple.com).
РЕДАКТИРОВАТЬ: я не видел, чтобы он переустановил XCode. Звучит странно. Убедитесь, что вы переустановили все, и что у вас есть правильные права. Однако установщик не обнаружил никаких проблем, и у вас все еще нет директивы / Developer, возможно, происходит что-то странное ...