Решено!
Проблема была не с сервером weblogic, проблема была в том, что мой исходный код был в отдельной папке вместо src, поэтому weblogic не смог найти пакет для сканирования в папке src, поэтому последобавив плагин ниже в pom.xml, развертывание прошло успешно -
<plugin>
<artifactId>maven-resources-plugin</artifactId>
<version>3.0.2</version>
<executions>
<execution>
<id>copy-source</id>
<phase>generate-sources</phase>
<goals>
<goal>copy-resources</goal>
</goals>
<configuration>
<outputDirectory>co/src</outputDirectory>
<overwrite>true</overwrite>
<resources>
<resource>
<directory>${basedir}/co/EBP</directory>
</resource>
</resources>
</configuration>
</execution>
</executions>
</plugin>
Используя этот плагин, я скопировал исходный код моей папки saperate в папку src с перезаписью как true.Следовательно, исходный код стал доступен в папке src.
Эту проблему также можно решить, упомянув исходную папку в файле .classpath.