Идея довольно проста:
Когда вам нужно скопировать файлы из папки 1 в папку 2, которые изменены друг относительно друга:
<exec program="C:\Windows\System32\xcopy.exe" failonerror="false" >
<arg line="${source} ${destination} /D /E /C /Q /H /R /Y /K" />
</exec>
Однако, если вам нужно также проверить временную метку, вам придется создать какой-то фильтр. Это вы можете сделать либо в пакетном файле, либо написать собственное консольное приложение.