Как указано в комментариях, это проблема дизайна. Мы закончили тем, что * cronjob pt-archiver
очистить потерянные свойства реестра от нашего кластера percona.
pt-archiver \
--run-time 4h \
--progress 10000 \
--limit 2000 \
--no-check-charset \
--source h=<hostname>,D=<database>,t=REG_RESOURCE_PROPERTY \
--purge \
--where '(REG_VERSION, REG_TENANT_ID) NOT IN (SELECT REG_VERSION, REG_TENANT_ID FROM REG_RESOURCE)'