У меня есть два набора ExpressionSet, которые я хотел бы объединить в один с именем exprs.br.ov,...
Я хочу выбрать подмножество моих данных на основе 2 условий: Во-первых, вот мои данные: Gene AreaID...
В настоящее время я пытаюсь сформировать цикл, в котором я могу тестировать различные запросы в...
Я работаю над созданием змеи, чтобы создать конвейер для моей работы. Мои входные файлы (Примеры...
У меня большой список генов, для которых я хочу найти гомологи. У меня также есть большой фрейм...
Я хочу знать, можно ли определить правило ввода, которое зависит от различных подстановочных знаков
У меня есть набор данных с корреляциями между генами и OTU.Я хочу построить эти корреляции с...
Я написал поток snakemake из fastp в gatk_bqsr, затем я встретил эту проблему в правиле index_bqsr:...
Я пытаюсь написать код, который заменяет повторяющиеся символы в строке символом и числом его...
Недавно я изучал алгоритм выравнивания последовательностей.После того, как я получил матрицу...
Этот вопрос о возможных будущих улучшениях задачи, с которой я почти закончил. Я загрузил базу...
У меня есть функция, которая берет строку ДНК и как вернуть правильно подобранный массив ДНК Код,...
При попытке перезагрузить таблицы перекрестных ссылок и hprd из UCSC Table Browser : kgxref=read
Я работаю с большими наборами данных> 40000 строк> = 200 столбцов.Я хочу получить значения AUC для...
учитывая текстовый файл FASTA (Rosalind_gc.txt), я должен пройти через каждую запись ДНК и...
Я пишу правило создания змеи, которое будет обрабатывать выполнение fastq-обрезки для данных...
Я новичок в использовании snakemake, у меня возникла проблема при выполнении шага gatk...
У меня есть матрица, которая имеет 562709 строк и 803 столбца, а для столбцов - 7 метаданных и 796...
Я создал файл bed вроде этого Simple_repeat KQ420259.1 45090 45150 (TTAT)n . + Simple_repeat...
Я реализовал алгоритм для расчета богатства аллелей на основе формул 1 - 3, представленных в:...
У меня есть файл с несколькими строками в формате FASTA, который я хочу разбить на части и...
Я новичок в использовании snakemake, у меня возникла проблема при использовании PICARD...
Я ищу подмножество набора данных гена, выбирая гены на основе их класса машинного обучения (метки...
Я новичок в использовании snakemake, у меня есть простая проблема при выполнении картирования в...
У меня есть набор данных, который я пытаюсь упорядочить по повторяющимся идентификаторам в 1...