Вопросы с тегом биоинформатика - PullRequest

Вопросы с тегом биоинформатика

0 голосов
1 ответ

У меня есть два набора ExpressionSet, которые я хотел бы объединить в один с именем exprs.br.ov,...

Camellia Hilker / 18 июня 2019
1 голос
3 ответов

Я хочу выбрать подмножество моих данных на основе 2 условий: Во-первых, вот мои данные: Gene AreaID...

DN1 / 17 июня 2019
0 голосов
0 ответов

В настоящее время я пытаюсь сформировать цикл, в котором я могу тестировать различные запросы в...

b34ts / 16 июня 2019
1 голос
1 ответ

Я работаю над созданием змеи, чтобы создать конвейер для моей работы. Мои входные файлы (Примеры...

David / 11 июня 2019
0 голосов
1 ответ

У меня большой список генов, для которых я хочу найти гомологи. У меня также есть большой фрейм...

Jonas Engelhardt / 11 июня 2019
2 голосов
1 ответ

Я хочу знать, можно ли определить правило ввода, которое зависит от различных подстановочных знаков

user10101904 / 04 июня 2019
0 голосов
0 ответов

У меня есть набор данных с корреляциями между генами и OTU.Я хочу построить эти корреляции с...

Paillou / 04 июня 2019
1 голос
0 ответов

Я написал поток snakemake из fastp в gatk_bqsr, затем я встретил эту проблему в правиле index_bqsr:...

Danielle / 04 июня 2019
1 голос
2 ответов

Я пытаюсь написать код, который заменяет повторяющиеся символы в строке символом и числом его...

alyssad / 02 июня 2019
0 голосов
1 ответ

Недавно я изучал алгоритм выравнивания последовательностей.После того, как я получил матрицу...

xiaoxu / 02 июня 2019
1 голос
0 ответов

Этот вопрос о возможных будущих улучшениях задачи, с которой я почти закончил. Я загрузил базу...

Mark Miller / 01 июня 2019
1 голос
2 ответов

У меня есть функция, которая берет строку ДНК и как вернуть правильно подобранный массив ДНК Код,...

Miguel A. Friginal / 01 июня 2019
1 голос
2 ответов

При попытке перезагрузить таблицы перекрестных ссылок и hprd из UCSC Table Browser : kgxref=read

Camellia Hilker / 01 июня 2019
0 голосов
0 ответов

Я работаю с большими наборами данных> 40000 строк> = 200 столбцов.Я хочу получить значения AUC для...

Benjamin Simpson / 31 мая 2019
0 голосов
3 ответов

учитывая текстовый файл FASTA (Rosalind_gc.txt), я должен пройти через каждую запись ДНК и...

Thomas William Dunn / 30 мая 2019
2 голосов
2 ответов

Я пишу правило создания змеи, которое будет обрабатывать выполнение fastq-обрезки для данных...

Al Bro / 30 мая 2019
0 голосов
1 ответ

Я новичок в использовании snakemake, у меня возникла проблема при выполнении шага gatk...

Peter Chung / 30 мая 2019
0 голосов
1 ответ

У меня есть матрица, которая имеет 562709 строк и 803 столбца, а для столбцов - 7 метаданных и 796...

na.0o0 / 29 мая 2019
0 голосов
1 ответ

Я создал файл bed вроде этого Simple_repeat KQ420259.1 45090 45150 (TTAT)n . + Simple_repeat...

jonny jeep / 28 мая 2019
3 голосов
0 ответов

Я реализовал алгоритм для расчета богатства аллелей на основе формул 1 - 3, представленных в:...

Max Hargreaves / 26 мая 2019
1 голос
4 ответов

У меня есть файл с несколькими строками в формате FASTA, который я хочу разбить на части и...

Tim Stack / 24 мая 2019
1 голос
1 ответ

Я новичок в использовании snakemake, у меня возникла проблема при использовании PICARD...

Peter Chung / 24 мая 2019
0 голосов
2 ответов

Я ищу подмножество набора данных гена, выбирая гены на основе их класса машинного обучения (метки...

DN1 / 23 мая 2019
0 голосов
1 ответ

Я новичок в использовании snakemake, у меня есть простая проблема при выполнении картирования в...

Peter Chung / 23 мая 2019
1 голос
1 ответ

У меня есть набор данных, который я пытаюсь упорядочить по повторяющимся идентификаторам в 1...

DN1 / 22 мая 2019
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...