Вопросы с тегом snakemake

6 голосов

2 ответов

Символьные (автоматически сгенерированные) каталоги через Snakemake

mschilli / 09 июля 2020

1 голос

2 ответов

Gensub внутри команды оболочки в Snakemake

Elysire / 09 июля 2020

1 голос

1 ответ

Как использовать Singularity в docker контейнере?

tetsuro90 / 03 мая 2020

0 голосов

1 ответ

Как легко выполнить анализ DAG конвейера?

qingyuanfl / 03 мая 2020

0 голосов

0 ответов

Демультиплексирование Snakemake: сопоставление выходных имен с отдельными sampleID

epigenome / 29 апреля 2020

1 голос

2 ответов

Специальный символ змеиной магии

par / 28 апреля 2020

1 голос

1 ответ

snakemake - как составить список входных файлов на основе предыдущего правила, которое выдает переменное количество файлов

vkkodali / 23 апреля 2020

1 голос

2 ответов

Snakemake: передать аргументы командной строки в сценарии

mbarete / 22 апреля 2020

1 голос

1 ответ

Рабочий процесс всегда приводит к «Ничего не делать», даже при форсировании правил

Christian O. / 22 апреля 2020

1 голос

0 ответов

Вложенная переоценка правил и контрольных точек в змейке

Uria Mor / 21 апреля 2020

0 голосов

1 ответ

snakemake отсутствует выходное исключение после завершения задания

Susheel Busi / 21 апреля 2020

1 голос

1 ответ

Snakemake не читает полный файл в R?

Exenter / 21 апреля 2020

0 голосов

1 ответ

Снейкмейк не может определить правило

Leandro Boralli / 17 апреля 2020

0 голосов

1 ответ

Использование snakemake для копирования файла в несколько каталогов, где подстановочный знак используется для части имени цели

J. Hey / 17 апреля 2020

0 голосов

0 ответов

Как определить рабочий процесс Snakemake с неизвестным количеством выходных файлов?

mpe / 17 апреля 2020

0 голосов

1 ответ

змеиный мастер интерпретирует полный путь как относительный путь

BCArg / 15 апреля 2020

1 голос

1 ответ

Snakemake InputFunctionException. AttributeError: у объекта 'Wildcards' нет атрибута

msimmer92 / 14 апреля 2020

3 голосов

2 ответов

Используйте специальные символы в разделе параметров Snakemake

pat2402 / 13 апреля 2020

0 голосов

2 ответов

snakemake. Как передать цель из командной строки при создании нескольких целей

J. Hey / 11 апреля 2020

4 голосов

1 ответ

Задание snakemake не выполняется, если указан параметр --drmaa-log-dir

January / 10 апреля 2020

1 голос

0 ответов

использование файлов .e и .o из qsub в качестве журнала для каждого правила в snakemake

BCArg / 10 апреля 2020

0 голосов

0 ответов

Обертки Snakemake работают без экрана, но не внутри экрана

Lisa R / 09 апреля 2020

0 голосов

1 ответ

включая суб-Snake-файлы и генерировать их результаты

gartician / 08 апреля 2020

1 голос

1 ответ

отправка задания создания змеи в кластер из (правильной) среды conda

BCArg / 07 апреля 2020

1 голос

1 ответ

Snakemake: «Неожиданный блокнот с ключевыми словами в определении правила» при попытке реализовать блокноты Jupyter

Shmuppel / 07 апреля 2020