Вопросы с тегом snakemake

0 голосов

0 ответов

Как забронировать место для работы в Snakemake?

Gutorm / 10 марта 2020

0 голосов

1 ответ

Snakemake - поддержка конфигурации Tibanna

Artiom Lichtenstein / 10 марта 2020

1 голос

1 ответ

Как определить список файлов, над которыми нужно развернуться в середине рабочего процесса?

Marleen / 06 марта 2020

0 голосов

1 ответ

Snakemake несколько входных файлов с расширением, но без повторений

net_programmer / 05 марта 2020

2 голосов

1 ответ

Snakemake - Проблема при попытке использовать global_wildcards (TypeError: ожидаемая строка, полученный список)

Neul Hyo / 04 марта 2020

0 голосов

0 ответов

MissingOutputException в змейке

Assa Yeroslaviz / 03 марта 2020

2 голосов

2 ответов

Snakemake: SFTP на локальной машине

Elysire / 03 марта 2020

1 голос

1 ответ

демоны работают с рабочим процессом?

Tom / 03 марта 2020

1 голос

1 ответ

Форматирование входных файлов Snakemake в оболочке

Tomas Bencomo / 03 марта 2020

1 голос

1 ответ

Получение подстановочных знаков из входных файлов, когда они не используются в выходных файлах

helgis / 02 марта 2020

2 голосов

2 ответов

Как получить доступ к шаблонам в директиве run

Nathan S. Watson-Haigh / 02 марта 2020

1 голос

1 ответ

Snakemake конвейер для запуска одного экземпляра правила 1 для создания нескольких файлов, а затем один экземпляр правила 2 на файл

torpzorrr / 26 февраля 2020

3 голосов

2 ответов

Как установить лимиты привязки памяти в snakemake

karldw / 26 февраля 2020

3 голосов

1 ответ

R Dr aws Графики с прямоугольниками вместо текста

Tomas Bencomo / 25 февраля 2020

1 голос

0 ответов

Запускайте распараллеленные задания змеиного мастера в заданном порядке c

Oneiros / 24 февраля 2020

0 голосов

1 ответ

запуск metaat2 с помощью snakemake, но не получение файлов bin

Kristy / 21 февраля 2020

1 голос

1 ответ

snakemake: ввод правил с другим шаблоном

PIFASTE / 21 февраля 2020

0 голосов

1 ответ

Snakemake зависает при попытке расширить большое количество файлов

jimroot / 20 февраля 2020

0 голосов

1 ответ

Есть ли способ обновить пакеты conda и bioconductor в yaml сразу?

Noob / 20 февраля 2020

3 голосов

1 ответ

Замена --cluster-config на --profile в snakemake

Manavalan Gajapathy / 20 февраля 2020

0 голосов

1 ответ

Как предоставить опции змеиного мейкера в самом Snakefile?

Manavalan Gajapathy / 20 февраля 2020

0 голосов

1 ответ

работает metab2 и checkM с помощью snakemake

Kristy / 20 февраля 2020

0 голосов

2 ответов

Объединить командные строки оболочки в змеиный мейк

user3224522 / 19 февраля 2020

0 голосов

1 ответ

Snakemake использует подстановочные знаки в пути функции python

Nono_sad / 13 февраля 2020

0 голосов

1 ответ

как snakemake может передавать данные между файловой системой nas и узлами кластера

julie Orjuela / 12 февраля 2020