Я разработал подпроцесс, который хорошо работает, если он указан как явный ввод в правиле all: rule...

Я хочу поставить в цикле змейку над двумя разными символами подстановки, которые, как мне кажется,...

Я загрузил пакет conda с github, чтобы внести несколько изменений, и хотел бы собрать этот...

Я пытаюсь установить Snakemake. Когда я пытаюсь использовать pip, я получаю следующее сообщение об...

Я хочу создать индекс генома с помощью STAR.Код bash работает в терминале, но я хочу преобразовать...

Я хочу знать, можно ли определить правило ввода, которое зависит от различных подстановочных знаков

Я хотел бы написать упаковщик змей *1001*, способный адаптировать его поведение на основе значений...

Я написал поток snakemake из fastp в gatk_bqsr, затем я встретил эту проблему в правиле index_bqsr:...

Я использую Snakemake для отправки работ в кластер. Я сталкиваюсь с ситуацией, когда я хотел бы...

Я хотел спросить сообщество Snakemake, удалось ли кому-нибудь успешно внедрить рабочие процессы...

Я пишу правило создания змеи, которое будет обрабатывать выполнение fastq-обрезки для данных...

Я новичок в использовании snakemake, у меня возникла проблема при выполнении шага gatk...

В сущности, я хочу знать, каков рекомендуемый способ обработки эквивалентных расширений файлов в...

Мне нужно запустить правило создания змеи в кластере, поэтому для некоторых правил мне нужны...

Я преобразую конвейер биоинформатики в создание змей и у меня есть скрипт, который перебирает M...

Я новичок в использовании snakemake, у меня возникла проблема при использовании PICARD...

Я хочу создать VennDiagramms с pybedtools. Существует специальный скрипт, использующий matplotlib,...

В настоящее время я сталкиваюсь с некоторыми проблемами со змеиным созданием промежуточных правил,...

Я пытаюсь использовать правила Snakemake в цикле, чтобы правило принимало выходные данные...

Я новичок в использовании snakemake, у меня есть простая проблема при выполнении картирования в...

При змейке Я получаю Building DAG of jobs... Nothing to be done. и если я попытаюсь snakemake -n...

У меня проблема с тем, чтобы заставить работать мою команду агрегата snakemake. Я надеюсь взять...

Я попытался перебрать список в сценарии R в правиле создания змеи, как в следующем файле змеи, но...

Я пытаюсь запустить код snakemake, используя файл .json в качестве входных данных. При проверке...

Я абсолютный новичок в создании змей. Я строю трубопровод, как я учусь. Мой вопрос: если Snakefile...