Я хотел спросить сообщество Snakemake, удалось ли кому-нибудь успешно внедрить рабочие процессы Snakemake в AWS Batch.
Страница 4 недавней публикации от октября 2018 г., по-видимому, предполагает, что Snakemake не работает на AWS, поскольку не может обрабатывать управление ресурсами. Вот публикация: Tibanna: программное обеспечение для масштабируемого выполнения переносимых конвейеров в облаке - https://www.biorxiv.org/content/early/2019/04/29/440974.full.pdf
Да, в той же статье предлагается, чтобы Snakemake хорошо работал с Google Cloud Platform (GCP).
Однако в документации Snakemake говорится: «Snakemake 4.0 и более поздние версии поддерживают выполнение в облаке через Kubernetes. Это не зависит от поставщика облачных вычислений». - https://snakemake.readthedocs.io/en/stable/executable.html#cloud-support
Поэтому я хотел бы знать, внедрил ли кто-нибудь Snakemake с AWS Batch.
Кроме того, кто-нибудь знает об этой странице github / bitbucket, которая подробно описывает успешную реализацию Snakemake с GCP.
Заранее спасибо.