Я пытаюсь создать базу данных makeblastdb в snakemake: workdir: "/path/to/workdir/"...
Я получаю следующую ошибку каждый раз, когда пытаюсь запустить свой скрипт snakemake: Building DAG...
Я думаю, что у меня есть простая проблема, но я не знаю, как ее решить. Моя входная папка содержит...
Я хотел бы использовать snakemake для анализа моих наборов данных. Поскольку я собираюсь работать с...
My {dir} - это переменная = / nameX / tissX / trimmed. Этот код я использую: HISAT2_INDEX_PREFIX =...
gdc-fastq-splitter разбивает файлы FASTQ на группы чтения. Например, если в dummy.fq.gz будут...
Я схожу с ума от змеиного мейкера. Я перепробовал все типы способов, используя конфигурационный...
У меня есть рабочий процесс, написанный на snakemake, который раздувает в одной точке большое...
Чтобы было понятно, я должен изменить пост. Ситуация такова, что в начале я хорошо запускал...
Я пытаюсь запустить отображение hisat2, используя змейку. По сути, я использую файл config.yaml...
Мы пытаемся запустить рабочие процессы Snakemake в Kubernetes на базовой инфраструктуре. Мы...
У меня есть несколько последовательностей ONT, которые были вызваны на MINIT. Таким образом, когда...