Вопросы с тегом snakemake - PullRequest

Вопросы с тегом snakemake

1 голос
1 ответ

Я пытаюсь создать базу данных makeblastdb в snakemake: workdir: "/path/to/workdir/"...

user3224522 / 11 декабря 2019
0 голосов
0 ответов

Я получаю следующую ошибку каждый раз, когда пытаюсь запустить свой скрипт snakemake: Building DAG...

Lamma / 11 декабря 2019
1 голос
1 ответ

Я думаю, что у меня есть простая проблема, но я не знаю, как ее решить. Моя входная папка содержит...

BioMart / 09 ноября 2019
0 голосов
1 ответ

Я хотел бы использовать snakemake для анализа моих наборов данных. Поскольку я собираюсь работать с...

Assa Yeroslaviz / 08 ноября 2019
1 голос
0 ответов

My {dir} - это переменная = / nameX / tissX / trimmed. Этот код я использую: HISAT2_INDEX_PREFIX =...

user3224522 / 07 ноября 2019
0 голосов
1 ответ

gdc-fastq-splitter разбивает файлы FASTQ на группы чтения. Например, если в dummy.fq.gz будут...

audald / 07 ноября 2019
1 голос
1 ответ

Я схожу с ума от змеиного мейкера. Я перепробовал все типы способов, используя конфигурационный...

user3224522 / 07 ноября 2019
2 голосов
0 ответов

У меня есть рабочий процесс, написанный на snakemake, который раздувает в одной точке большое...

jcmcnch / 07 ноября 2019
0 голосов
2 ответов

Чтобы было понятно, я должен изменить пост. Ситуация такова, что в начале я хорошо запускал...

Dianyu Chen / 06 ноября 2019
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь запустить отображение hisat2, используя змейку. По сути, я использую файл config.yaml...

user3224522 / 05 ноября 2019
0 голосов
0 ответов

Мы пытаемся запустить рабочие процессы Snakemake в Kubernetes на базовой инфраструктуре. Мы...

vemonet / 01 ноября 2019
2 голосов
1 ответ

У меня есть несколько последовательностей ONT, которые были вызваны на MINIT. Таким образом, когда...

Erin Young / 30 октября 2019
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...