У меня время от времени возникают проблемы (linux / ubuntu), потому что работа, запущенная Snakemake, заканчивается из-за других процессов, которые я не контролирую. Казнь может быть довольно неблагодарной.
Я мог бы проверить доступную память через onstart: или даже до того, как запустил команду, но это неуклюже и даже небезопасно.
Похоже, программы plink чтобы иметь возможность зарезервировать место - есть ли способ сделать это в (или для) Snakemake? Я использую директиву run:, поэтому меня поддерживает python ...