В записной книжке R (с использованием типа вывода html_notebook) кнопка «Предварительный просмотр» создает файл .nb.html, в котором фрагменты кода Stan не отображаются. Кто-нибудь знает почему? Это ошибка?
Уточнение: Блок кода Stan работает нормально. Вывод доступен для будущих кусков кода. Но в отрендеренном HTML-файле код Stan не виден.
Вот полный документ по уценке в качестве воспроизводимого примера.
---
title: "Stan chunk reprex"
output: html_notebook
---
```{r}
library(rstan)
```
```{r}
N <- 18
y <- c(rep(1, 12), rep(0, 6))
stan_data <- list(N = N, y = y)
```
```{stan, output.var = "bin_unif"}
data {
int<lower = 0> N;
int<lower = 0, upper = 1> y[N];
}
parameters {
real<lower = 0, upper = 1> theta;
}
model {
theta ~ uniform(0, 1); // prior
y ~ bernoulli(theta); // likelihood
}
```
```{r}
fit_bin_unif <- sampling(bin_unif, data = stan_data)
fit_bin_unif
```