big.mark = "," не работает с функцией kable в Rmarkdown при транспонировании фрейма данных - PullRequest
Новая
       11

big.mark = "," не работает с функцией kable в Rmarkdown при транспонировании фрейма данных

0 голосов
/ 29 октября 2018

У меня есть фрейм данных с одной строкой и множеством столбцов, и я хочу представить его с помощью функции kable в Rmarkdown (вывод в формате PDF). Для лучшего представления я использовал функцию «transpose» и сгенерировал новый фрейм данных. Проблема в том, что когда я использую: big.mark = ",", он не работает на транспонированном фрейме данных, хотя он работает, когда я использую оригинальный фрейм данных. Я прилагаю здесь пример этой проблемы с помощью кода, который я написал, чтобы продемонстрировать эту проблему: 

```{r warning = FALSE, error = FALSE, message=FALSE, echo = FALSE, results = 
'hide'}
library(kableExtra)
library(tidyverse)
```

```{r warning = FALSE, error = FALSE, message=FALSE, echo = FALSE}
df <- data.frame(x=1000, y=scales::percent(0.34), z=500000)
kable(df, format = "latex", caption = "big.mark problem", booktabs=TRUE, 
format.args = list(big.mark = ","))
```

```{r warning = FALSE, error = FALSE, message=FALSE, echo = FALSE}
df_transpose <- t(data.frame(x=1000, y=scales::percent(0.34), z=500000))
kable(df_transpose, format = "latex", caption = "big.mark problem", 
booktabs=TRUE, format.args = list(big.mark = ","))
```

```{r warning = FALSE, error = FALSE, message=FALSE, echo = FALSE}
df_transpose_df <- as.data.frame(t(data.frame(x=1000, 
y=scales::percent(0.34), z=500000)))
kable(df_transpose_df, format = "latex", caption = "big.mark problem", 
booktabs=TRUE, format.args = list(big.mark = ","))
```

```{r warning = FALSE, error = FALSE, message=FALSE, echo = FALSE}
df_transpose_tibble <- as.tibble(t(data.frame(x=1000, 
y=scales::percent(0.34), z=500000)))
kable(df_transpose_tibble, format = "latex", caption = "big.mark problem", 
booktabs=TRUE, format.args = list(big.mark = ","))
```

Первая таблица отображает первое число как: 1000. и другие таблицы отображают их как: 1000. Я хочу, чтобы все выглядело как первое.

Спасибо!

1 Ответ

0 голосов
/ 29 октября 2018

У вас есть проблемы с типами данных здесь. Забыв на минуту о kable материалах, изучите класс и структуру каждого созданного вами объекта.

Прежде всего, это тот факт, что scales::percent форматирует число и возвращает строку. 

library(dplyr)
library(tidyr)

scales::percent(0.34)
#> [1] "34.0%"
class(scales::percent(0.34))
#> [1] "character"

Поскольку data.frame имеет значение по умолчанию stringsAsFactors = TRUE, та строка, которую вы создали для y, теперь является фактором - возможно, это не проблема, но, вероятно, неудобно и не то, что вы могли ожидать. 

df <- data.frame(x=1000, y=scales::percent(0.34), z=500000)
df
#>      x     y     z
#> 1 1000 34.0% 5e+05
class(df)
#> [1] "data.frame"
str(df)
#> 'data.frame':    1 obs. of  3 variables:
#>  $ x: num 1000
#>  $ y: Factor w/ 1 level "34.0%": 1
#>  $ z: num 5e+05

Посмотрите документы для t: возвращает матрицу. Матрицы имеют только один тип данных, поэтому все приводится к строкам. 

df_transpose <- t(data.frame(x=1000, y=scales::percent(0.34), z=500000))
class(df_transpose)
#> [1] "matrix"
str(df_transpose)
#>  chr [1:3, 1] "1000" "34.0%" "5e+05"
#>  - attr(*, "dimnames")=List of 2
#>   ..$ : chr [1:3] "x" "y" "z"
#>   ..$ : NULL

Когда вы снова преобразовали это в фрейм данных, вы снова получили коэффициенты, а не числовые значения. 

df_transpose_df <- as.data.frame(t(data.frame(x=1000, y=scales::percent(0.34), z=500000)))
class(df_transpose_df)
#> [1] "data.frame"
str(df_transpose_df)
#> 'data.frame':    3 obs. of  1 variable:
#>  $ V1: Factor w/ 3 levels "1000","34.0%",..: 1 2 3
#>   ..- attr(*, "names")= chr  "x" "y" "z"

as_tibble не приводит к факторам, поэтому отличие от предыдущего df состоит в том, что у вас есть все строки вместо факторов. 

df_transpose_tibble <- as_tibble(t(data.frame(x=1000, y=scales::percent(0.34), z=500000)))
class(df_transpose_tibble)
#> [1] "tbl_df"     "tbl"        "data.frame"
str(df_transpose_tibble)
#> Classes 'tbl_df', 'tbl' and 'data.frame':    3 obs. of  1 variable:
#>  $ V1: chr  "1000" "34.0%" "5e+05"

Основная проблема с каждым из них заключается в том, что после этих преобразований вы затем вызываете функции форматирования - предоставляя аргумент big.mark для kable или непосредственно используя вызовы format function kable - для строк тогда как они работают только с числами.

Вместо этого вы можете начать со всего числового (или установить stringsAsFactors = FALSE), установить форматирование так, как вам нужно для каждого из этих столбцов, а затем использовать функцию изменения формы, предназначенную для работы с фреймами данных. Одним из распространенных вариантов является tidyr::gather, который предоставит вам данные более длинной формы, которые вы искали, но сохранит их в виде фрейма данных / таблицы. 

all_numeric <- data.frame(x = 1000, y = 0.34, z = 500000)
all_numeric %>%
  mutate(x = formatC(x, big.mark = ","),
         y = scales::percent(y)) %>%
  gather(key, value)
#>   key value
#> 1   x 1,000
#> 2   y 34.0%
#> 3   z 5e+05

Создано в 2018-10-29 пакетом Представить (v0.2.1)

...