Возможно, на вашем компьютере запущено несколько версий Python, и Jupyter выбирает версию, в которой нет этого пакета. Чтобы выяснить, какая версия Python работает в вашем ноутбуке, сделайте это в Jupyter:
import os
import inspect
inspect.getfile(os)
Затем вы можете запустить pip для этой конкретной версии:
python3.6 -m pip install pypyodbc
В качестве альтернативы, вы можете попробовать удалить пакет и переустановить через pip, если он все еще не работает.