Полагаю, вы использовали Excel или LibreOffice Calc. Открытие файла в Excel для просмотра вывода свернет ваш формат. Как правило, лучше всего избегать Excel. Вы используете Python? Проще всего загрузить образец представления, заменить целевой столбец и сохранить:
ss = pd.read_csv('sample_submission.csv')
ss.loc[:, 'target'] = preds
ss.to_csv('sub.csv',
index=False)