Если вы используете эту машину только для разработки (кажется, вы используете: "для целей тестирования") , я не думаю, что это должно быть большой проблемой.
Я видел такое сообщение несколько раз и никогда не экспериментировал с какими-либо проблемами, которые могут быть связаны.
(Если бы это было 4.0 и 4.1, может быть, так как было добавлено много важных новых вещей ... Но между 5.0 и 5.1 я не думаю)
Чтобы исправить эту «проблему», вам необходимо установить новую версию библиотек, используемых PHP ... И я не уверен, что самая последняя версия PHP 5.2 (5.2.10) использует libmysql 5.1. ..
И вы, вероятно, не хотите ничего перекомпилировать самостоятельно ^^
Другим решением будет переход на MySQL 5.0.x; но мне было бы все равно, для испытательной машины, если я не столкнусь с грубым поведением.