Не удается использовать conda для установки программного обеспечения или обновления?

Question

Я пытаюсь использовать conda для установки некоторого биоинформационного программного обеспечения, такого как запонки:

conda install -c bioconda cufflinks

Но я получаю эту ошибку:

Error: Invalid index file: r/linux-64/repodata.json.bz2

И это та же ошибка для любой команды, использующей conda, кто-нибудь знает, как это исправить? похоже, я должен удалить все и начать с Cero.

Answer 1

Биоконде требуется менеджер пакетов conda.

Если у нас установлена ​​Anaconda, по умолчанию она уже доступна в ней.

Для Bioconda рекомендуется версия Python 3.

Нам нужно добавить канал биоконды, так как другие каналы зависят от биоконды.

в

conda config - по умолчанию добавлены каналы

conda config --add каналы conda-forge

Конда Конфиг - Добавить каналы Биоконда

Теперь попробуйте установить

       conda install -c bioconda cufflinks

Установка будет успешно завершена.

Ссылка: https://bioconda.github.io/